Kommuneoverlegens oppgaver er mangfoldige, men fordeler seg hovedsakelig på tre hovedområder:

•    medisinskfaglig rådgiver for hele kommunen
•    smittevern og helseberedskap
•    miljørettet helsevern

I tillegg arbeider kommuneoverlegen med blant annet følgende:
•    folkehelse
•    rådgivning
•    godkjenning av virksomheter
•    forvaltning av bl.a. legetjenesten
•    kvalitetsutvikling
•    helsetjenesteplanlegging
•    medisinsk faglig oppfølging av helsetilbudet i kommunen